1985年原湖南医科大学与国家医药管理总局联合试办五年制药学专业，1996年筹建药学系，1997年面向全国招生，学制四年，授予理学学士学位。药学一级学科为湖南省一级重点学科，具有药学一级学科硕、博士学位授予权，2011年新增生物与医药工程博士学位授予权；药学专业为湖南省重点专业和特色专业。

学院本科生专业以大药学教育为基础，采用“前期趋同，后期分化，个性发展”的培养模式。以培养学生的创新创业精神为核心，注重基本技能和实际工作能力的培养。学院构建了较为完善的生物功能表征、小分子药物发现、设计与合成、新型药物传递系统设计与制备、药物质量控制与药物代谢研究的教学科研体系，为高素质的药学专业人才培养提供了强力支撑。